122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3786 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
406 aa  777    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  84.65 
 
 
404 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.62 
 
 
407 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  55.74 
 
 
403 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.87 
 
 
405 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  54.93 
 
 
404 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  57.26 
 
 
404 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  57.58 
 
 
407 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  57.26 
 
 
404 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  56 
 
 
407 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.5 
 
 
404 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.98 
 
 
404 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  54.06 
 
 
403 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.43 
 
 
406 aa  322  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  47.3 
 
 
418 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.44 
 
 
408 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.28 
 
 
415 aa  292  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.5 
 
 
390 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.21 
 
 
401 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.05 
 
 
407 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  46.63 
 
 
396 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.84 
 
 
404 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.84 
 
 
404 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.95 
 
 
419 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.18 
 
 
399 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.57 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.64 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  44.7 
 
 
413 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  36.73 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1649  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.38 
 
 
365 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203663  normal  0.0487751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2055  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.83 
 
 
365 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0119985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.6 
 
 
370 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.37 
 
 
390 aa  186  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  38.87 
 
 
386 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  38.99 
 
 
375 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.73 
 
 
375 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  35.69 
 
 
394 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.75 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.44 
 
 
180 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  25.7 
 
 
418 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.09 
 
 
183 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3254  hypothetical protein  30.77 
 
 
467 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  30.43 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  30.79 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  20.11 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.54 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.75 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.5 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.77 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  31.91 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  36.03 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  35.48 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  35.48 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  35.48 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  35.48 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  31.85 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  36.76 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  36.76 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  36.76 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  36.76 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  31.85 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  33.58 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  31.85 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  36.03 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  36.03 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  36.03 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  32.9 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  29.21 
 
 
455 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  31.71 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  32.26 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  33.96 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  33.96 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  33.96 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  28.74 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  33.08 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.62 
 
 
471 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  33.08 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.04 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.25 
 
 
371 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  26.76 
 
 
352 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  26.48 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  26.4 
 
 
352 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.63 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.84 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.72 
 
 
368 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.48 
 
 
352 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.66 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  23.33 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  23.33 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.27 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.46 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.65 
 
 
334 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.76 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.95 
 
 
215 aa  54.7  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.89 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  26.12 
 
 
349 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.4 
 
 
423 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  34.56 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>