138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2080 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  83.7 
 
 		 412 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 412 aa  795    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5150  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.73 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00907952  normal  0.925389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4336  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.93 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  31.49 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.82 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  28.65 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.46 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.82 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  33.6 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.82 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  28.46 
 
 		 352 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.73 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.82 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  29.34 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  28.42 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  26.06 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.67 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  26.06 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  30.14 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.81 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.65 
 
 		 334 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.84 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.9 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.02 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  30.23 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.3 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  30.23 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.46 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.93 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.71 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.69 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  25.64 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  28.33 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.49 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  27.99 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.05 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  28.03 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  29.89 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  28.37 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.6 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0677  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.94 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.61 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  29.53 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.63 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.95 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.74 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  23.5 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.68 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.21 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.94 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.5 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  24.45 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.23 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  30.82 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  34.09 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  24.1 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.75 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  27.1 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  26.35 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  26.24 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.09 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  26.35 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.09 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  32.09 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  27.69 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.27 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  27.27 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.33 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  27.39 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  32.91 
 
 		 173 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  27.98 
 
 		 401 aa  57  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  27.27 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  30.19 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  30.19 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  30.19 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  27.57 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  41.67 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.67 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.62 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.67 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.97 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  27.71 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  25.73 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  26.79 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.88 
 
 		 181 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  31.82 
 
 		 180 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.59 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  29.09 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  30.72 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  28.75 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  33.03 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>