114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  100 
 
 		 355 aa  704    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  35.96 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  35.96 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  35.67 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  35.39 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  35.67 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.11 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  33.71 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  35.59 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  30.81 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  30.81 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  34.08 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.6 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.86 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.92 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  30.59 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.05 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.88 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.93 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.7 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.92 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.72 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.91 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.27 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  26.93 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  34.34 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  23.58 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.45 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.95 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.64 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  22.75 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.04 
 
 		 215 aa  57  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  24.48 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  24.93 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  25.22 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.3 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.72 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.91 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.63 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.72 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.76 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  26.42 
 
 		 418 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.33 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.61 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  30.16 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.23 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.35 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.59 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  35.65 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.65 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4336  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.94 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.44 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.2 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26 
 
 		 443 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.17 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.73 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.97 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  30.11 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.72 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.05 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  36.89 
 
 		 175 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  32.43 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  29.25 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.92 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  24.73 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  28.12 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  23.76 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  29.63 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.5 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.7 
 
 		 136 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5150  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.24 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00907952  normal  0.925389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 		 351 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.87 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  24.12 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  30.87 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  29.27 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  25.6 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  28.23 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  25.6 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  25.6 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  25.6 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  29.27 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  24.16 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  24.16 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  31.2 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  24.16 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  28.05 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  24.93 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.28 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.75 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.42 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  31.71 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  29 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  29 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  31.53 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  27.09 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>