73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2872 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  70.2 
 
 		 360 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.36 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  58.36 
 
 		 351 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.07 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  40.35 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.66 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.53 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  39.24 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  39.23 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  39.35 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.33 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  35.85 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.06 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.53 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.3 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  39.59 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.02 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.94 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  32.8 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.13 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  38.81 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.98 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.53 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.47 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  36.47 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.51 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.72 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.67 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.28 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.61 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.33 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  35.82 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.42 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.62 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  29.12 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  35.8 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  38.51 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  34.12 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.19 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  33.63 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  36.29 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.46 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  24.59 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  24.59 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  26.67 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.83 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.9 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  25.93 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  25.94 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.94 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  24.78 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  24.21 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  25.65 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  25.65 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.92 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  23.05 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  25.99 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.78 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.68 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  24.11 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  22.75 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.67 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  28.36 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  22.69 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.92 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.87 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  31.9 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.19 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.14 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  28.07 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.66 
 
 		 180 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>