89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0829 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
409 aa  813    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  75.06 
 
 
415 aa  628  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.01 
 
 
375 aa  97.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  25.83 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  24.41 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  24.87 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  24.87 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  24.87 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  24.61 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.87 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  24.87 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  22.49 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.46 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  24.87 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  24.74 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  24.74 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  27.93 
 
 
414 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  22.28 
 
 
371 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  36.26 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.62 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.38 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  33.72 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  32.77 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.87 
 
 
183 aa  57.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  29.35 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  27.96 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  29.35 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  31.78 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  32.52 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  30.85 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  30.85 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  25.81 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  25.81 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  25.81 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  25.81 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  25.81 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.3 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  39.74 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  29.79 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  23 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  30 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  30 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  29.41 
 
 
371 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  31.19 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  30.11 
 
 
173 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  30.08 
 
 
404 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  29.29 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  28.12 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  29.79 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.35 
 
 
371 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0677  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.49 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.5 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.46 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.56 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  29.41 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  22.83 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  26.6 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.75 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  28.16 
 
 
348 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.92 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  24.86 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.18 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.09 
 
 
180 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.65 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  30.09 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  31.63 
 
 
103 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
165 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  31.43 
 
 
362 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.84 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.53 
 
 
347 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.47 
 
 
371 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.31 
 
 
401 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.07 
 
 
181 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>