129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1691 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  733    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  47.58 
 
 
396 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.11 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.11 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.28 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.55 
 
 
390 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.89 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.18 
 
 
406 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.38 
 
 
404 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.29 
 
 
415 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.88 
 
 
408 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.88 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.64 
 
 
405 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  35.8 
 
 
418 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  37.6 
 
 
404 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  36.46 
 
 
403 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.36 
 
 
407 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  36.54 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  36.26 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.11 
 
 
407 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.93 
 
 
390 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.91 
 
 
443 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  36.46 
 
 
403 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  39.94 
 
 
413 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.26 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.43 
 
 
399 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.63 
 
 
407 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  31.94 
 
 
385 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.75 
 
 
406 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  37.43 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.48 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.94 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.64 
 
 
419 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.98 
 
 
375 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2055  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.62 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0119985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1649  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.9 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203663  normal  0.0487751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.05 
 
 
370 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.6 
 
 
412 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.98 
 
 
412 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  34.03 
 
 
394 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.09 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.33 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.75 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  32.95 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  22.74 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  22.74 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.99 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.08 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  28.85 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  21.23 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  28.08 
 
 
404 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  32.93 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  25.89 
 
 
352 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  31.18 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  30.49 
 
 
408 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
404 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.75 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.01 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.07 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  25.07 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3254  hypothetical protein  23.3 
 
 
467 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  25.07 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.07 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  25.33 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  25.33 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  25.07 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.35 
 
 
375 aa  56.6  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  33.04 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.01 
 
 
216 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  33.33 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.86 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.67 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  25.52 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  24.48 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  41.18 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  30 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.4 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  27.04 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5150  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.91 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00907952  normal  0.925389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  24.75 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.74 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  27.17 
 
 
343 aa  53.9  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  27.86 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  29.38 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  26.15 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>