96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0499 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
390 aa  734    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.77 
 
 
404 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.31 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.06 
 
 
404 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.63 
 
 
401 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  45.57 
 
 
396 aa  275  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.5 
 
 
406 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.98 
 
 
407 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  46.37 
 
 
403 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.46 
 
 
405 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  45.9 
 
 
404 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  44.76 
 
 
404 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  46.03 
 
 
404 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.02 
 
 
407 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.27 
 
 
404 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.34 
 
 
408 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.32 
 
 
404 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  45.94 
 
 
403 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.21 
 
 
407 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.2 
 
 
407 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.31 
 
 
406 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  44.54 
 
 
418 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.9 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.71 
 
 
419 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  42.21 
 
 
386 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.61 
 
 
399 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.36 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.04 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  42.09 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.66 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  35.95 
 
 
385 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.04 
 
 
375 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  36.39 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1649  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.94 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203663  normal  0.0487751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.43 
 
 
370 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2055  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.11 
 
 
365 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0119985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.64 
 
 
375 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  34.04 
 
 
394 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.22 
 
 
180 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3254  hypothetical protein  29.64 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.95 
 
 
183 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.02 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  26.77 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  20.16 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  29.03 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.54 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.41 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  30.12 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  28.39 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  33.82 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  31.58 
 
 
428 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  25.31 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  33.09 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  28.21 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.86 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.08 
 
 
371 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  31.67 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  21.97 
 
 
359 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  21.97 
 
 
359 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.68 
 
 
375 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  25.75 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  30.83 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  30.83 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  30.83 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  30.28 
 
 
404 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.05 
 
 
416 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  29.58 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  30.28 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  29.58 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  29.58 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  29.58 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  29.58 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  27.01 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.73 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.2 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.46 
 
 
409 aa  49.7  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  28.06 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.62 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  27.56 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.05 
 
 
345 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.09 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.68 
 
 
215 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  27.14 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  21.57 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  21.34 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  31.39 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>