121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1255 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  100 
 
 		 418 aa  821    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.2 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.21 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.37 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.61 
 
 		 404 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.7 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.3 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.5 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  51.12 
 
 		 404 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  50.27 
 
 		 403 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  52.23 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  51.96 
 
 		 404 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.45 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.88 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.61 
 
 		 408 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  47.91 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.96 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  49.61 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.5 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  50.82 
 
 		 403 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.19 
 
 		 401 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.88 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.6 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  44.02 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.31 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.76 
 
 		 419 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.17 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 		 399 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  35.14 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  34.69 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.1 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  35.53 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.99 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1649  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.66 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203663  normal  0.0487751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2055  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.58 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0119985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.18 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  31.79 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.04 
 
 		 180 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  40.69 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.69 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  30.21 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.02 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  30.25 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.75 
 
 		 183 aa  96.3  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  23.26 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3254  hypothetical protein  26.02 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.32 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  30.51 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.1 
 
 		 216 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  31.18 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  26.9 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  26.9 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  31.1 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  30 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  30 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  29.33 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.27 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  33.53 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  26.45 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  26.45 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  26.45 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  26.45 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  30.49 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.9 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  30.49 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.84 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  30.49 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  26.17 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  29.88 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  29.88 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  29.88 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.27 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.25 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  28.83 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  24.26 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  29.82 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  29.82 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  29.82 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  29.82 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  29.45 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  27.65 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  28.66 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  25.9 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  27.01 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  30.61 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.47 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.97 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.3 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.72 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  28.31 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  26.16 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  24.41 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  30 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>