Gene MCAP_0540 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0540 
Symbol 
ID3828397 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp648710 
End bp649948 
Gene Length1239 bp 
Protein Length412 aa 
Translation table
GC content18% 
IMG OID637823695 
ProductYeeE/YedE family protein, putative 
Protein accessionYP_424511 
Protein GI83319782 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.0115974 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAAAACTA AATGAATTCA ACCACTTATT GCTTTATTTT TTATAGTTTT ATTAAGTATT 
TTAACTATAT TTTTAAAATC AACTAATTTA AGATTGTCTT TAATTATTAG TTTTATATTA
GGTTGTGTAA TTAGTAGATC TAGTTTTGAT TTTTCAACAG GAATTAAACA AGCTTATTTA
TATAAAAACA CTAATTTAAC AAAAGCTTTT ATACTTTTAC TAGCTTTAAG TATGATAATA
GTTTTTATAT TAAAAATAAT TTTTGATTTT TATAATATTA ATTTAATTTC AAATATTAGT
AATACAAACA ATATTAGTAT ATTCACTTTA GTTGGTAGTT TTATTATTGG ATTTTCTATA
ATAATTACAA GTAATTGTGC TTCAGGTATT TTATTTGATC TAGCAAAAGG AAAATTAAAA
GGTTTAATTG GTGTTATCTT TTTTATAATA GGATCAGTAA TTGGATATAT TAGTTTAAAG
TTATTTTCTA AAACTAATTT ATTTATAAAA ACTAGTAGTA AAGTTTTTTT AGCAAATAAT
ATTTATTATT TAGCAATACT TATTTGTAGT TTATTAATAC TTTTTGTTTT ATATTTAATA
GTTAAAAAAT ATGAAAATAA ATATTTAAAA CAAGATTTTA ATTTAAAAAT AAATAATAAT
TTAAATGATC AATTAATTAA TAATTCATCA AAAAAATTGT TTAGTTATAA GAATTATTAT
AGATTATTTA TAAAAAATTG ATCTTTTATG ATTAGTAGTG TTTTAATAAG TATTTGTGCA
ACAATAATTT TAGTTATAAA TAACAAAACT TGAGGAGTTT CAAAACCTTT TTTAACATTT
TTTGTTTATT TATGTAGTGT TTTTAAGATC AATTTATCAA ATGTTATGTT TGATGAGATT
ATAAAAATTA CTAATAATGG GTTATTAAAT GATAGTTCTA CACTCATAAA TATCAGTTTT
TTTATAGGTT GTTTAGTTTG TTTTTTACTA GCAAATAAAT TTAAATTTGA ATTAAAAATT
AATAAAAAAG AATTTTTCTG TTTTACAATT GGTGGATTTT TATTAGGATT TGGAGCAAGT
TTAGCAAATG GATGTAGTGT TGGAGCGATG TATTCAAAAA TTAGTACATT TGATTTATCT
GGATGAGTAT TTTTAATTGG TATGATTATT GGAATATTTA TTGGAATTAA AATTTTTATT
AAAAAACAAA ATAATATAAT TCAAATTAAT AGGAGGTAG
 
Protein sequence
MKTKWIQPLI ALFFIVLLSI LTIFLKSTNL RLSLIISFIL GCVISRSSFD FSTGIKQAYL 
YKNTNLTKAF ILLLALSMII VFILKIIFDF YNINLISNIS NTNNISIFTL VGSFIIGFSI
IITSNCASGI LFDLAKGKLK GLIGVIFFII GSVIGYISLK LFSKTNLFIK TSSKVFLANN
IYYLAILICS LLILFVLYLI VKKYENKYLK QDFNLKINNN LNDQLINNSS KKLFSYKNYY
RLFIKNWSFM ISSVLISICA TIILVINNKT WGVSKPFLTF FVYLCSVFKI NLSNVMFDEI
IKITNNGLLN DSSTLINISF FIGCLVCFLL ANKFKFELKI NKKEFFCFTI GGFLLGFGAS
LANGCSVGAM YSKISTFDLS GWVFLIGMII GIFIGIKIFI KKQNNIIQIN RR