111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2308 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  93.32 
 
 		 404 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 404 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  93.56 
 
 		 404 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  80.2 
 
 		 403 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  78.71 
 
 		 403 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  74.07 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  74.57 
 
 		 404 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.71 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  65.5 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.5 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  62.75 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.65 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.9 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.5 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.51 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.51 
 
 		 415 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  52.62 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.67 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.52 
 
 		 407 aa  292  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.8 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.16 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.22 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.22 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.27 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  42.34 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.4 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.41 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  37.33 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  43.42 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.9 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  39.18 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.18 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  37.88 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2560  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.84 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.18 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2055  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.99 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0119985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1649  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.54 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203663  normal  0.0487751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  36.87 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.67 
 
 		 180 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  29.06 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.04 
 
 		 183 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.42 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.88 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.9 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3254  hypothetical protein  26.59 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  22.64 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  28.4 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  32.34 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  29.63 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  29.63 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  28.49 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  29.63 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.82 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  33.53 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  26.52 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.02 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.59 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.17 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  31.64 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  31.64 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  31.64 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  32.91 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  30.11 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  32.91 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  32.91 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  32.91 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  32.91 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.61 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  30.11 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  30.11 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  32 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  30.9 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  32.56 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  31.65 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  25 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  30.51 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  30.51 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  30.51 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  30.51 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.7 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  24.75 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.97 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.22 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  23.93 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  23.93 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  30.07 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4640  hypothetical protein  54.9 
 
 		 97 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22404  normal  0.548162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  29.59 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  32.28 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  32.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  32.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  32.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  32.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  32.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.9 
 
 		 215 aa  53.1  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.71 
 
 		 355 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1576  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.08 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.59 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  24.28 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>