122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0063 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
471 aa  941    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  38.89 
 
 
404 aa  88.2  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  36.73 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  36.73 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  38.28 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  35.92 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  36.72 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.44 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  35.1 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  37.5 
 
 
394 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  39.22 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.24 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.94 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  37.25 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  37.25 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  36.75 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  37.25 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  37.25 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  37.25 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.73 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  43.16 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  35.21 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.11 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  33.1 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  33.1 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  33.1 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  33.1 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  33.1 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  32.28 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  32.28 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  32.28 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  35.16 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  32.28 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  34.62 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  34.62 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  34.62 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.36 
 
 
332 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  31.5 
 
 
404 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  31.5 
 
 
404 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  37.04 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  31.5 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.04 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  32.28 
 
 
404 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.85 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  31.91 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.85 
 
 
406 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  35.71 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.46 
 
 
415 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  27.74 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  31.88 
 
 
415 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  34.51 
 
 
359 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  34.51 
 
 
359 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.48 
 
 
216 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.34 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.23 
 
 
402 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  38.06 
 
 
428 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.83 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  35.34 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  36.73 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.07 
 
 
404 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  37.31 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.31 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.38 
 
 
409 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  33 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  33 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33 
 
 
401 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  33 
 
 
401 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  33 
 
 
401 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  33 
 
 
401 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  33 
 
 
401 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  34.09 
 
 
418 aa  57.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.37 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  35.11 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.37 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  34.81 
 
 
403 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  35.11 
 
 
404 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.86 
 
 
407 aa  56.6  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.37 
 
 
401 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.08 
 
 
408 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0677  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.05 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.3 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  33.33 
 
 
403 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5150  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.02 
 
 
416 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00907952  normal  0.925389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 
406 aa  54.7  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.34 
 
 
399 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  32.11 
 
 
343 aa  53.5  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  31.63 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4336  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.96 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  27.84 
 
 
385 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.38 
 
 
215 aa  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.71 
 
 
415 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 
443 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  34.23 
 
 
373 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  28.49 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.45 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.62 
 
 
407 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  31.25 
 
 
371 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>