98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1655 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  203  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  76.24 
 
 		 359 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  76.24 
 
 		 359 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  59.8 
 
 		 343 aa  131  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.24 
 
 		 352 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  63.27 
 
 		 352 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  63.27 
 
 		 352 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  63.27 
 
 		 352 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  62.24 
 
 		 352 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  62.24 
 
 		 349 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  62.24 
 
 		 352 aa  130  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.71 
 
 		 334 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  47.96 
 
 		 344 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  41.84 
 
 		 385 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  48.19 
 
 		 375 aa  90.1  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  40.7 
 
 		 359 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.3 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.18 
 
 		 330 aa  73.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  34.31 
 
 		 371 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  38.89 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  34.34 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.71 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.36 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.99 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.65 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.14 
 
 		 371 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 423 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.58 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.66 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 401 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  30.34 
 
 		 401 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  30.34 
 
 		 401 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  30.34 
 
 		 401 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  30.34 
 
 		 401 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 404 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  36.46 
 
 		 415 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  30.34 
 
 		 404 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  30.34 
 
 		 404 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 403 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.96 
 
 		 373 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  34.65 
 
 		 455 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.67 
 
 		 373 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.25 
 
 		 423 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  29.09 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.63 
 
 		 416 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.29 
 
 		 351 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.67 
 
 		 415 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  31.96 
 
 		 367 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 		 345 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  35.79 
 
 		 418 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  31.46 
 
 		 402 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.96 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  30.3 
 
 		 405 aa  45.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  30.3 
 
 		 351 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  30.3 
 
 		 420 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  30.93 
 
 		 356 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  27.47 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.63 
 
 		 409 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 355 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.11 
 
 		 404 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 406 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  30 
 
 		 402 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  30 
 
 		 402 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.84 
 
 		 471 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  31.25 
 
 		 360 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.72 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.29 
 
 		 408 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  32.18 
 
 		 413 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  27.84 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.9 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.59 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  31.48 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0561  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.39 
 
 		 390 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  26.6 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  31 
 
 		 371 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  31.11 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.91 
 
 		 419 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  32.61 
 
 		 365 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  28.72 
 
 		 396 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.93 
 
 		 412 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>