More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1354 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 307 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.81 
 
 		 307 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.77 
 
 		 310 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  75.08 
 
 		 310 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.28 
 
 		 313 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.71 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.71 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.19 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3878  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  51.79 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.3 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 		 349 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 		 285 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.15 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  45 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.93 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  43.42 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  43.62 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  43.62 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  40.48 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  45.26 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  44.04 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  39.1 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  38.75 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00197888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  38.25 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  37.89 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.89 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 867 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.13 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  38.28 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0350  peptide ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  39.35 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 		 283 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  39.54 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.04 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.64 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.59 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  37.59 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  37.59 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.59 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  37.59 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  37.41 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.91 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.6 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 		 468 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  37.06 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>