More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4173 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.87 
 
 
303 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.87 
 
 
303 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.97 
 
 
313 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.9 
 
 
307 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
310 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.19 
 
 
344 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.27 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.25 
 
 
342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  61.84 
 
 
310 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.19 
 
 
307 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3878  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  47.83 
 
 
305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
349 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
323 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145081  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
280 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
285 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  44.52 
 
 
288 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 
304 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  47.06 
 
 
304 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.17 
 
 
284 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 
280 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 
282 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
468 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
285 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
306 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 
310 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
299 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.41 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  39.8 
 
 
307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  40.14 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
307 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
274 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  39.8 
 
 
307 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
307 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  41.99 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.88 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  41.34 
 
 
283 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  40.99 
 
 
283 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.34 
 
 
283 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  40.89 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  40.89 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  40.89 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  40.89 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  40.89 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
307 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 
284 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
283 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
300 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.28 
 
 
296 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.76 
 
 
285 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
296 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  37.68 
 
 
867 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  37.12 
 
 
330 aa  204  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
304 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
295 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  37.59 
 
 
302 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
310 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
299 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
310 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.55 
 
 
288 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
316 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
299 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
258 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  38.54 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  40.41 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
287 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  36.9 
 
 
300 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.62 
 
 
331 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
341 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
295 aa  198  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00197888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
309 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0350  peptide ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.84 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  36.21 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>