More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06810 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  100 
 
 
355 aa  701    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  69.37 
 
 
336 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  69.58 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  62.58 
 
 
329 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  65.07 
 
 
706 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  62.27 
 
 
329 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  66.05 
 
 
338 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  63.94 
 
 
388 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  64.26 
 
 
324 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  64.62 
 
 
327 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  64.6 
 
 
331 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  65.94 
 
 
326 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  62.88 
 
 
326 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  62.8 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  59.69 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.81 
 
 
343 aa  401  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  65.02 
 
 
345 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  61.66 
 
 
342 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  62.35 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  61.37 
 
 
340 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  60.87 
 
 
327 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  59.51 
 
 
328 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  62.58 
 
 
335 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  62.62 
 
 
326 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  62.61 
 
 
357 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  55.92 
 
 
393 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  60.98 
 
 
357 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  61.8 
 
 
326 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  60.49 
 
 
330 aa  384  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  62.11 
 
 
327 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  58.1 
 
 
335 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  61.94 
 
 
327 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  62.26 
 
 
325 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  57.1 
 
 
344 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  58.7 
 
 
351 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  60.19 
 
 
345 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  58.49 
 
 
334 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  64.05 
 
 
308 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  55.66 
 
 
348 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  57.05 
 
 
339 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  59.75 
 
 
349 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  59.75 
 
 
349 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  59.75 
 
 
349 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  58.99 
 
 
330 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  53.66 
 
 
354 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  56.92 
 
 
325 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  56.25 
 
 
329 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  56.47 
 
 
334 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  53.19 
 
 
370 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  55.38 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  54.55 
 
 
373 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  53.27 
 
 
335 aa  332  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  53.31 
 
 
332 aa  329  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  52.32 
 
 
342 aa  325  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  52.85 
 
 
324 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  52.25 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  52.65 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  51.09 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  50.62 
 
 
336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  52.15 
 
 
327 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  51.58 
 
 
324 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  51.58 
 
 
324 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  49.54 
 
 
328 aa  310  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  50.81 
 
 
327 aa  309  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.95 
 
 
324 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  50.95 
 
 
326 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  50.62 
 
 
346 aa  305  7e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  51.75 
 
 
326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  50.15 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  50.62 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  49.84 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  51.72 
 
 
323 aa  302  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  50.63 
 
 
326 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  48.46 
 
 
333 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  51.9 
 
 
326 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  49.53 
 
 
326 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  47.69 
 
 
327 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.88 
 
 
337 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  47.68 
 
 
334 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  48.02 
 
 
337 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  47.84 
 
 
333 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  50.16 
 
 
355 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.42 
 
 
337 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.24 
 
 
341 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.42 
 
 
337 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.31 
 
 
351 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  46.35 
 
 
320 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  48.76 
 
 
328 aa  291  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
334 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  45.85 
 
 
325 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.73 
 
 
347 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  47.62 
 
 
326 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  47.62 
 
 
326 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  47.52 
 
 
325 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>