More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2098 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  100 
 
 		 338 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  77.91 
 
 		 706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  70.95 
 
 		 336 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  71.56 
 
 		 336 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  64.4 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  64.4 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  64.94 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  64.51 
 
 		 327 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  64.2 
 
 		 326 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  65.72 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  63.38 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  62.15 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  66.05 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  64.62 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  66.67 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.42 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  64.29 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  62.11 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  63.58 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  63.47 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  60.56 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  62.7 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  61.35 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  59.69 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  63.83 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  60.98 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  59.69 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  59.13 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  61.18 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  60.25 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  59.38 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  55.12 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  59.38 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  64.4 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  57.91 
 
 		 325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  57.63 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  57.54 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  55.59 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  55.14 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  55.73 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  56.25 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  51.84 
 
 		 354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  55.83 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  55.83 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  55.83 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  56.7 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  54.32 
 
 		 351 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  53.52 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  54.24 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  54.94 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  54.32 
 
 		 334 aa  321  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  52.82 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50.46 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.93 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  48.93 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  48.93 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  49.54 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  46.25 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  49.69 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  49.53 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  46.39 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  45.99 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  45.86 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.13 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  46.44 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  44.55 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  46.91 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  47.55 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  45.57 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  46.77 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3743  transketolase central region  46.69 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  44.25 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  45.77 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  45.78 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.29 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3963  transketolase central region  45.78 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  47.55 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  47.55 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  47.81 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  45.27 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  45.4 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  45.4 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  49.54 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  48.36 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  46.93 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.87 
 
 		 337 aa  275  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  45.99 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  45.7 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  45.7 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  43.9 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  45.99 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  45.7 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  49.22 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.15 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.7 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  46.77 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  44.65 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  49.07 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  46.39 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  44.79 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>