More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6069 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  100 
 
 		 328 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  70.34 
 
 		 329 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  70.03 
 
 		 329 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  69.11 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  68.62 
 
 		 340 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  68.29 
 
 		 326 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  68.48 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  68.2 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  68.9 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  68.31 
 
 		 327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  66.98 
 
 		 327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  67.88 
 
 		 353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  69.85 
 
 		 324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  68.03 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  67.38 
 
 		 345 aa  431  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  63.27 
 
 		 329 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  68.37 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  64.02 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  64.51 
 
 		 706 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  64.2 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  63.33 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  64.35 
 
 		 336 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  63.11 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  64.58 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  63.09 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  60 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  57.14 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  62.95 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  60.62 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.21 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  60.56 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  59.51 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  64.72 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  60.56 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  57.19 
 
 		 351 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  52.78 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  53.27 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  57.55 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  57.55 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  57.55 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  51.06 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  53.21 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  54.11 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  52.74 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  54.46 
 
 		 373 aa  335  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  55.35 
 
 		 334 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  53.63 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  54.86 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  53.99 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  53.99 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  53.68 
 
 		 324 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  52.45 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  52.83 
 
 		 329 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  53.97 
 
 		 334 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  52.65 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  49.84 
 
 		 349 aa  306  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  50.47 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  51.1 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  49.06 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  45.94 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  49.69 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.23 
 
 		 337 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  47.43 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  48.59 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  49.06 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  47.8 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  44.65 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  48.14 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  48.11 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  45.9 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  48.12 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  46.67 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.21 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  49.69 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.21 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  50.16 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  48.15 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.59 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  45.82 
 
 		 325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  48.88 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  47.24 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  48.77 
 
 		 324 aa  281  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  47.02 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.12 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.13 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  47.66 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  47.35 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  47.13 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  47.35 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  47.35 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  47.35 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  47.83 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  46.82 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  48.9 
 
 		 326 aa  279  6e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  50 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.97 
 
 		 341 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  47.68 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  46.65 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  48.22 
 
 		 355 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  47.35 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>