More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4027 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  100 
 
 		 326 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  90.8 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.62 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.48 
 
 		 393 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  68.42 
 
 		 345 aa  441  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  65.34 
 
 		 327 aa  441  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  66.56 
 
 		 327 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  64.67 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  68.29 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  64.42 
 
 		 326 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  64.42 
 
 		 324 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  64 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  63.3 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  60 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  62.84 
 
 		 388 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  59.69 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  62.65 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  61.04 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  62.77 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  65.18 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  69.71 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  63.75 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  60.79 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  58.64 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  61.8 
 
 		 706 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  60.62 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  57.93 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.52 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  59.69 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  59.38 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  59.69 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  59.69 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.8 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  58.57 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  53.65 
 
 		 325 aa  348  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  53.54 
 
 		 349 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  53.54 
 
 		 349 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  53.54 
 
 		 349 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  50.47 
 
 		 344 aa  341  9e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  51.86 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  54.23 
 
 		 334 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  50.46 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  48.78 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  51.23 
 
 		 329 aa  331  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  51.83 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  50.31 
 
 		 325 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  50.94 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  52.12 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.83 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  51.7 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  52.13 
 
 		 324 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  52.13 
 
 		 324 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  52.32 
 
 		 334 aa  321  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  49.38 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  48.81 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  45.37 
 
 		 320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  46.79 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  44.88 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  48.63 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  47.38 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  45.76 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  45.71 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  46.36 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  45.99 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  45.9 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  44.92 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  45.57 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.59 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  43.73 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  45.92 
 
 		 325 aa  285  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  43.73 
 
 		 326 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  46.15 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  45.96 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  44.04 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  44.44 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  45.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  43.69 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  43.87 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.34 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.9 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  44.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  45 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.73 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  44.44 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  44.98 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  44.14 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  44.14 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3236  Transketolase central region  46.04 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  44.14 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  44.14 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  45.51 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>