More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3817 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  100 
 
 		 326 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  90.8 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  69.66 
 
 		 345 aa  447  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  65.54 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  67.79 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  60.49 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  64.65 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  65.03 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  64.95 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  63.8 
 
 		 326 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  63.61 
 
 		 327 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  60.62 
 
 		 329 aa  427  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  65.85 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  62.46 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  62.69 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  62.73 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  63.38 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  64.69 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  62.01 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  62.96 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  60 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  64.54 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  67.75 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  58.33 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  60 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  58.54 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  60.31 
 
 		 706 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.52 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  60 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  60.92 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  60.31 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.62 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  59.69 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  59.19 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  55.56 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  55.21 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  55.21 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  55.21 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  52.8 
 
 		 351 aa  345  7e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  54.55 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  52.16 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  50.16 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  50 
 
 		 354 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  51.39 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  52.02 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  52.44 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  51.95 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  51.23 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  50.31 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  51.39 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  51.7 
 
 		 334 aa  321  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  50.6 
 
 		 349 aa  318  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.22 
 
 		 324 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  50.91 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  50.91 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  49.55 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  46.73 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  48.32 
 
 		 346 aa  305  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  46.95 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  48.33 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  48.02 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  45.4 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  46.2 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  46.01 
 
 		 328 aa  292  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  46.48 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  46.46 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  44.51 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  44.51 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  44.75 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.13 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  46.18 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.32 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.32 
 
 		 325 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  45.02 
 
 		 325 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  46.27 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.02 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  44.54 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  44.65 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  45.48 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  44.48 
 
 		 326 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.25 
 
 		 337 aa  281  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  45.18 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  45.18 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  45.18 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  45.18 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.87 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  46.56 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  46.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  43.87 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  45.37 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  44.48 
 
 		 327 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  43.87 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  47.27 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  45.09 
 
 		 327 aa  278  6e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>