More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3966 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  100 
 
 		 357 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  74.55 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  70.21 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  65.57 
 
 		 393 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  75.32 
 
 		 308 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  70.43 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  67.07 
 
 		 327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  69.79 
 
 		 324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  69.11 
 
 		 327 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  64.55 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  64.24 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  67.27 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  69.44 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  68.71 
 
 		 345 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  68.09 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  63.58 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  64.83 
 
 		 353 aa  434  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  64.85 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  66.87 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  64.95 
 
 		 326 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.31 
 
 		 329 aa  424  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  64.67 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  65.93 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  63.2 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  64.65 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  63.72 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  60.91 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  59.29 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  60.53 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  60 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  62.04 
 
 		 706 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  60.98 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  60.98 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  57.5 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  58.36 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  58.9 
 
 		 343 aa  362  8e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  53.42 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  55.28 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  54.98 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  53.17 
 
 		 373 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  51.83 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  56.52 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  55.89 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  55.89 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  55.89 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  50.96 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  54.97 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  55.35 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  51.51 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  52.89 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  54.01 
 
 		 330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  52.35 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.61 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  50.3 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  50.3 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  51.67 
 
 		 325 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50.15 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  48.94 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  47.71 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  46.69 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  46.67 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  50.15 
 
 		 335 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.27 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.27 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.09 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  47.88 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  46.87 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  50.3 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.63 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.33 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  46.01 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  46.97 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3236  Transketolase central region  49.85 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  49.08 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  46.83 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  48.92 
 
 		 326 aa  288  9e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  44.61 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  48.18 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  48.04 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  48.93 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  45.76 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.13 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  46.57 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  46.45 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  45.62 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.83 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.22 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  46.65 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  46.99 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  46.67 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  46.08 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.5 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  45.32 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>