More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3747 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  100 
 
 		 355 aa  720    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  70.62 
 
 		 326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  67.08 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  68.63 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  65.3 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  65.3 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  65.22 
 
 		 326 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  65.38 
 
 		 324 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  65.06 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  65.63 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  66.46 
 
 		 326 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  63.66 
 
 		 326 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  67.4 
 
 		 326 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  67.08 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  61.83 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  61.39 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  60.87 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  60.19 
 
 		 333 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  59.06 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  58.44 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  54.8 
 
 		 342 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  53.13 
 
 		 336 aa  361  9e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  52.48 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  54.4 
 
 		 327 aa  349  5e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  51.55 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  51.39 
 
 		 328 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  51.45 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  54.29 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  53.65 
 
 		 320 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  54.89 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  52.35 
 
 		 323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  50.8 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  51.09 
 
 		 326 aa  322  7e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.26 
 
 		 320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  48.75 
 
 		 325 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  48.75 
 
 		 325 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  49.84 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.84 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  49.84 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  48.91 
 
 		 324 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  50 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  49.38 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  48.77 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  49.07 
 
 		 332 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  49.38 
 
 		 339 aa  311  9e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.44 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  48.62 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  50.77 
 
 		 702 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.12 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  47.81 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  50.77 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  50.45 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.12 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  48.78 
 
 		 342 aa  309  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  52.7 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  45.79 
 
 		 327 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  49.84 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04223  2-oxoacid dehydrogenase E1 component, beta subunit  92.86 
 
 		 156 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0932514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  50.78 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  48.14 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  50.97 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  51.38 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  48.92 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.37 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  50.46 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  48.75 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04225  2-oxoacid dehydrogenase E1 component, beta subunit  93.04 
 
 		 169 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0435645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  47.44 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  45 
 
 		 325 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  45 
 
 		 325 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.38 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  48.31 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  45.88 
 
 		 354 aa  298  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.15 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  50 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  49.1 
 
 		 335 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  48.44 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  47.85 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  48.18 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  44.69 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.45 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  45.88 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  48.11 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  46.42 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.86 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.04 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  47.62 
 
 		 338 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  48.44 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  46.42 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  48.6 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  47.71 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.32 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  47.68 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.34 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>