More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5543 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5543  cytochrome P450  100 
 
 
391 aa  779    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0230136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3897  cytochrome P450  49.08 
 
 
403 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.43 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.58 
 
 
412 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.91 
 
 
398 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  37.27 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  32.99 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  33.59 
 
 
410 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.78 
 
 
412 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.6 
 
 
426 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.67 
 
 
412 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.67 
 
 
412 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.68 
 
 
402 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  34.23 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.42 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.66 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.66 
 
 
407 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.66 
 
 
407 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.59 
 
 
420 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  31.27 
 
 
405 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.85 
 
 
411 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.66 
 
 
436 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.23 
 
 
400 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  33.75 
 
 
409 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.53 
 
 
419 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.24 
 
 
380 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  31.03 
 
 
415 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.34 
 
 
414 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.22 
 
 
407 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  32.1 
 
 
429 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  32.14 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  35.23 
 
 
395 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  36.09 
 
 
404 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  32.08 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  34.66 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  34.64 
 
 
393 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.84 
 
 
411 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.02 
 
 
410 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  31.49 
 
 
404 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  31.67 
 
 
410 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.22 
 
 
410 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  31.49 
 
 
404 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  31.49 
 
 
404 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  30.52 
 
 
422 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.16 
 
 
400 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  33.42 
 
 
408 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  32.97 
 
 
408 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  31.54 
 
 
405 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.58 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  34.19 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  31.57 
 
 
405 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.75 
 
 
402 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  31.09 
 
 
409 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  36.62 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  36.62 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  31.27 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  36.62 
 
 
447 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  34.63 
 
 
408 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.14 
 
 
405 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.5 
 
 
417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.16 
 
 
411 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.44 
 
 
402 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.16 
 
 
408 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.17 
 
 
401 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30.19 
 
 
403 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.37 
 
 
423 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  31.03 
 
 
413 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  34.72 
 
 
400 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.58 
 
 
388 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  30.47 
 
 
442 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.76 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  35.71 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  31.45 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  30.94 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.97 
 
 
412 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  33.33 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  31.64 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  32.97 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  28.97 
 
 
405 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  34.27 
 
 
415 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  36.98 
 
 
430 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.7 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  31.75 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  32.11 
 
 
399 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  31.99 
 
 
439 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  34.79 
 
 
443 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.09 
 
 
416 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.88 
 
 
398 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.17 
 
 
409 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.25 
 
 
406 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  30.67 
 
 
468 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  26.65 
 
 
408 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  34.21 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  32.75 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  29.56 
 
 
398 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  30.05 
 
 
399 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  36.36 
 
 
411 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  32.65 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>