99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3142 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3142  TspO- and MBR-like protein  100 
 
 
139 aa  273  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3382  TspO and MBR like proteins  82.84 
 
 
173 aa  184  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.344591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2615  TspO and MBR like proteins  61.36 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2570  TspO and MBR like proteins  61.36 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2609  TspO and MBR like proteins  62.12 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0191924  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  49.23 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1976  TspO and MBR like proteins  54.01 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  32.03 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  30.94 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  36.88 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  31.39 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  38.03 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  38.03 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  35.77 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  33.85 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  35.92 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  34.85 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  34.81 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  38.46 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  34.11 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  38.69 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  31.54 
 
 
157 aa  60.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  33.33 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  35.25 
 
 
158 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  35.34 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  33.33 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  32.12 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  35.16 
 
 
199 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  34.35 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  35.88 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  32.8 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  33.08 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  32.82 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  32.85 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  27.13 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  32.56 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  29.69 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1791  TspO and MBR like proteins  33.08 
 
 
249 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  29.1 
 
 
174 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  32.81 
 
 
169 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  32 
 
 
162 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  32.03 
 
 
165 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  33.59 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  29.93 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  31.16 
 
 
166 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  30.65 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  33.59 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  29.77 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  27.41 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  33.08 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  35.16 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  30.23 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  33.33 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  28.89 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  31.01 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  28.57 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  30.58 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  30.58 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  28.47 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  29.6 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  31.06 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  31.45 
 
 
170 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0665  CrtK protein  31.06 
 
 
135 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.802516  normal  0.0539005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  28.95 
 
 
177 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  35.61 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  28.91 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  34.38 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  29.01 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1656  TspO and MBR like protein  48.33 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0270  hypothetical protein  28.68 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  30.47 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0904  TspO and MBR related proteins  30 
 
 
251 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44370  predicted protein  32 
 
 
311 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  25.76 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  25 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  25.76 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  30.83 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  23.48 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0265  hypothetical protein  28.68 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  30.94 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  27.41 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  29.71 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  23.48 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  23.48 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  23.48 
 
 
151 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  28.12 
 
 
153 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  34.75 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  33.07 
 
 
159 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  29.01 
 
 
180 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  29.03 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  35.11 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  30.77 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  32.03 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  29.1 
 
 
284 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2735  TspO and MBR like protein  29.6 
 
 
209 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  0.0772192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>