52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1656 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1656  TspO and MBR like protein  100 
 
 		 117 aa  214  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  61.73 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1976  TspO and MBR like proteins  52.04 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  34.48 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  41.67 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  40 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  43.24 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  36.67 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3142  TspO- and MBR-like protein  48.68 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  40.43 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  39.78 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  41.03 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  39.78 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  39.78 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  46.25 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  43.24 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  32.43 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  37.84 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  39.02 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  43.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  32.18 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  40.7 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  40.85 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  39.71 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  38.89 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  43.01 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  40 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  36.11 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  32.5 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  32.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  35.56 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  32.88 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  40.7 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  35.71 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  34.21 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 		 172 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  25 
 
 		 151 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  43.53 
 
 		 180 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  35.71 
 
 		 165 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  31.03 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  34.41 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  38.1 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  38.89 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  26.14 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  23.26 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  38.1 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  25 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  23.86 
 
 		 151 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  23.86 
 
 		 153 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  37.8 
 
 		 165 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>