117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6800 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  100 
 
 
152 aa  285  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  51.18 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  49.66 
 
 
158 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  42.28 
 
 
158 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  54.1 
 
 
169 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  47.1 
 
 
163 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  53.23 
 
 
167 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  45.07 
 
 
160 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  43.92 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  46.62 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  42.67 
 
 
181 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  42.67 
 
 
172 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  46.88 
 
 
162 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  46.21 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  46.46 
 
 
161 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  45.99 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  47.97 
 
 
169 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  39.86 
 
 
188 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  48.41 
 
 
168 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  44.08 
 
 
159 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  41.83 
 
 
158 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  45.38 
 
 
137 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  40.52 
 
 
158 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  47.62 
 
 
150 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  40.41 
 
 
159 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  40.41 
 
 
158 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  44.97 
 
 
155 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  40.41 
 
 
159 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  42.28 
 
 
153 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  45.83 
 
 
157 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  44.27 
 
 
171 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  44.27 
 
 
171 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  44.27 
 
 
171 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  43.57 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  42 
 
 
165 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  41.55 
 
 
172 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  41.03 
 
 
162 aa  99.4  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  44.19 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  46.28 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  48.03 
 
 
166 aa  97.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  38.82 
 
 
177 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  39.86 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  34.38 
 
 
163 aa  94.4  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  39.86 
 
 
158 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  51.59 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  37.09 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  42.14 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  36.17 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  45.52 
 
 
180 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  39.2 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  42.52 
 
 
173 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  39.22 
 
 
185 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  37.09 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  42.37 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  40.15 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  41.73 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  45.69 
 
 
165 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  41.73 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  36.17 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  38.89 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  37.67 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  44.53 
 
 
168 aa  87.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  40.52 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  34.25 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  39.06 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  36.31 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  41.73 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  39.84 
 
 
165 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  40.71 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  38.1 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  41.41 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  47.62 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  37.5 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  38.26 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  39.84 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  38.28 
 
 
169 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  41.01 
 
 
178 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  37.5 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  31.85 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  35.71 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  37.3 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  41.6 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  38.1 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  40.32 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  39.68 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  38.58 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  35.65 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  36.43 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  32.28 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0265  hypothetical protein  34.25 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  36.91 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0270  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  28.85 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2190  TspO and MBR like protein  35.77 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2735  TspO and MBR like protein  29.17 
 
 
209 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  33.6 
 
 
284 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3615  TspO and MBR like proteins  37.1 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  34.62 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  28.39 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>