122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4445 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  100 
 
 		 162 aa  313  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  58.73 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  47.71 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  41.67 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  54.84 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  52.03 
 
 		 181 aa  120  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  45.45 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  53.66 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  44.93 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  44.37 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  42.18 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  47.2 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  50.78 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  44.52 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  50.67 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  42.5 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  49.61 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  43.84 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  47.33 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  42.07 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  47.97 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  46.94 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  44.44 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  40.94 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  44.14 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  45.26 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  45.67 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  42.66 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  43.92 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  46.34 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  44.44 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  44.8 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  48.44 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  49.17 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  38.99 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  45.83 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  39.6 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  40.25 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  42.4 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  38.78 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  43.31 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  38.78 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  44.52 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  44.62 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  42.67 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  39.33 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  45.31 
 
 		 180 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  43.85 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  44.62 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  42.66 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  40.69 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  42.86 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  44.27 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  39.13 
 
 		 173 aa  97.4  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  41.27 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  40.3 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  43.24 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  44.83 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  41.1 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  42.28 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  37.16 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  41.67 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  43.08 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  42.31 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  43.08 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  36.16 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  39.06 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  36.81 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  44.27 
 
 		 184 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  46.4 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  42 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  38.96 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  44.26 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  43.08 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  37.84 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  37.01 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2190  TspO and MBR like protein  36.67 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  42.28 
 
 		 137 aa  84.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  41.91 
 
 		 199 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  41.67 
 
 		 172 aa  84  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  40.16 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  41.73 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  39.53 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  39.52 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  35.66 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  36.51 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  33.56 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  33.07 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  39.37 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  38.71 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  36.51 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3615  TspO and MBR like proteins  38.71 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  33.83 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0270  hypothetical protein  37.6 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0265  hypothetical protein  38.4 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  36.5 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  31.75 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  29.27 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1791  TspO and MBR like proteins  30.37 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0904  TspO and MBR related proteins  32.59 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.292104 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>