117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4823 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  100 
 
 		 169 aa  320  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  98.16 
 
 		 165 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  85.89 
 
 		 165 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  69.4 
 
 		 165 aa  190  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  52.32 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3711  TspO and MBR like protein  59.26 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  hitchhiker  0.000364074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  49.02 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  48.05 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  50.97 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  51.3 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  53.73 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  46.27 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  44.59 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  40 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  41.06 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  39.73 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  39.62 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  39.87 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  34.97 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  35.33 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  44.44 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  45.16 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  36 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  38.69 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  40 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  38.71 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  40 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  39.31 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  37.01 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  37.88 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  39.39 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  36.64 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  38.58 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  37.58 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  37.32 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  37.93 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  34.97 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  35.94 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  34.23 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  40.46 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  39.34 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  32.87 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  32.87 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  38.46 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  34.48 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  35.62 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  40 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  38.85 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  39.01 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  36.22 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  35.88 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  35.77 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  33.09 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  36.8 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  33.07 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  30.56 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  30.71 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  32.59 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  38.73 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  35.86 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  35.09 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  38.89 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  31.79 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  38.28 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  34.23 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1976  TspO and MBR like proteins  35 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  33.59 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  29.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  37.69 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  33.33 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  34.72 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  31.54 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  31.9 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  37.76 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  30.83 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  36.51 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  33.11 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  33.11 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  35.82 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  32.41 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  29.92 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  31.47 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  29.1 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  32.33 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  29.49 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  22.46 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0789  TspO and MBR related proteins  31.97 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2570  TspO and MBR like proteins  32.97 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2615  TspO and MBR like proteins  32.97 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  28.89 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2735  TspO and MBR like protein  31.3 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1613  TspO and MBR like protein  27.52 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0665  CrtK protein  32.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.802516  normal  0.0539005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2609  TspO and MBR like proteins  31.87 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0191924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3142  TspO- and MBR-like protein  32.81 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  28.19 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>