64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1791 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1791  TspO and MBR like proteins  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0904  TspO and MBR related proteins  70.33 
 
 
251 aa  370  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8326  predicted protein  40.72 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239804  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44370  predicted protein  32.76 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  33.59 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  34.68 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  30.08 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  33.07 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  30.37 
 
 
162 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  32.35 
 
 
284 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  29.69 
 
 
158 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  29.69 
 
 
159 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  29.23 
 
 
188 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  27.82 
 
 
159 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  29.41 
 
 
159 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  27.07 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  27.5 
 
 
163 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  28.79 
 
 
164 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  28.35 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  30.4 
 
 
170 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  30.77 
 
 
165 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  29.41 
 
 
158 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  27.33 
 
 
157 aa  52.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  30.77 
 
 
165 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  26.47 
 
 
158 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  30.37 
 
 
157 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  29.84 
 
 
165 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  28.65 
 
 
173 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  29.86 
 
 
158 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  32 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  29.1 
 
 
169 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  27.78 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  30.71 
 
 
158 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  25 
 
 
172 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  27.27 
 
 
167 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  27.34 
 
 
135 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  27.21 
 
 
157 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  27.61 
 
 
163 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  26.32 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  28.68 
 
 
166 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  28.57 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  33.59 
 
 
146 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  28.24 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3142  TspO- and MBR-like protein  30.47 
 
 
139 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206469  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  31.3 
 
 
165 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  31.39 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  26.98 
 
 
181 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  30.16 
 
 
170 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  25.19 
 
 
185 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  26.77 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  30.53 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  30.6 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  28.57 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1976  TspO and MBR like proteins  27.61 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  26.56 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  30.34 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  29.77 
 
 
165 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  24.09 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  27.61 
 
 
159 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  25.19 
 
 
169 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0665  CrtK protein  25.78 
 
 
135 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.802516  normal  0.0539005 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  29.92 
 
 
160 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>