43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0904 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0904  TspO and MBR related proteins  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1791  TspO and MBR like proteins  70.33 
 
 
249 aa  370  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44370  predicted protein  32.27 
 
 
311 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8326  predicted protein  42.01 
 
 
164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239804  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  30.38 
 
 
165 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  32.26 
 
 
184 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  32.59 
 
 
162 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  33.86 
 
 
162 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  28.57 
 
 
160 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  30.88 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  28.77 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  27.91 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  30.65 
 
 
165 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  30.4 
 
 
170 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  26.92 
 
 
159 aa  48.9  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  27.42 
 
 
163 aa  48.5  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  25.38 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  31.58 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  23.85 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  27.01 
 
 
173 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  32 
 
 
157 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  26.54 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  26.32 
 
 
159 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  29.41 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  26.15 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  27.54 
 
 
158 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  25.38 
 
 
158 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  27.94 
 
 
169 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  32.85 
 
 
165 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  25.37 
 
 
159 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  25.37 
 
 
158 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  31.3 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  30.65 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  30.77 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  28.35 
 
 
166 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  27.56 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  29.13 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  31.3 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  28.15 
 
 
157 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  22.39 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  31.75 
 
 
171 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  27.13 
 
 
181 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  27.07 
 
 
161 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>