17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44370 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44370  predicted protein  100 
 
 
311 aa  640    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8326  predicted protein  42.77 
 
 
164 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0904  TspO and MBR related proteins  32.27 
 
 
251 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1791  TspO and MBR like proteins  32.76 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  28.99 
 
 
160 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  31.97 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  30.23 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  30.71 
 
 
156 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  30.43 
 
 
170 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  28.33 
 
 
165 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  27.87 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  28.15 
 
 
135 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  28.93 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  22.56 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  26.87 
 
 
159 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  26.87 
 
 
158 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  26.15 
 
 
162 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>