114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1722 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  100 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  87.01 
 
 		 155 aa  274  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  87.66 
 
 		 155 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  69.93 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  58.67 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  61.04 
 
 		 163 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  51.3 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  55.64 
 
 		 165 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  51.88 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  50.38 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  49.62 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  51.18 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3711  TspO and MBR like protein  52.24 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  hitchhiker  0.000364074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  38 
 
 		 188 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  38.93 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  39.19 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  37.41 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  39.72 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  45.04 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  37.16 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  34.48 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  36.81 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  44.62 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  34.67 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  40.88 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  37.42 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  36.18 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  36.8 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  35.67 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  41.73 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  36.91 
 
 		 165 aa  87.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  36.05 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  41.09 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  35.29 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  38.46 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  40.15 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  38.62 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  37.9 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  30.52 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  34.59 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  38.69 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  34.67 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  39.2 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  39.68 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  32 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  37.24 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  37.23 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  36.09 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  36.09 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  30.82 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  36.84 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  38.16 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  36.3 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  41.94 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  34.48 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  34.96 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  37.9 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  33.55 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  32.81 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  36.62 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  35.71 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  29.24 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  30.95 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  36.09 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  36.57 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  39.37 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  34 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  36.84 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  29.93 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  30.95 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  35.04 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  33.33 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  37.78 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  37.96 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  36.36 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  36.15 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  42.74 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  31.5 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  36.29 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  28.95 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  27.2 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  27.2 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  29.33 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  30.77 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  28.57 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  33.09 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  28.67 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  32.85 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  29.41 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  28.8 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  26.4 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  25.55 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  36.3 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  25.55 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>