113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3744 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  86.45 
 
 		 155 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  87.66 
 
 		 154 aa  273  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  69.93 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  61.59 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  60.65 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  50.32 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  51.13 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  47.01 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  51.41 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  46.27 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  45.52 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3711  TspO and MBR like protein  50 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  hitchhiker  0.000364074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  41.5 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  39.31 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  42.4 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  39.6 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  38.67 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  47.41 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  37.16 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  37.5 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  35.14 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  40 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  36 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  41.01 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  44.8 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  40.3 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  36.31 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  35.14 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  41.73 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  36.05 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  39.13 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  39.2 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  39.73 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  34 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  40.31 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  35.71 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  36.67 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  36.09 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  40.15 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  35.04 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  38.64 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  31.17 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  35.46 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  34.13 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  35.62 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  34.46 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  34.46 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  37.5 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  37.59 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  36 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  32.19 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  34.67 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  40.32 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  30.99 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  36.96 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  37.69 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  35.77 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  38.82 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  38.35 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  34.93 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  39.39 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  35.22 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  35.22 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  35.56 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  36.51 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  35.17 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  32.8 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  37.98 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  33.6 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  35.07 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  36.18 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  39.68 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  36.03 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  35.77 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  34.9 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  33.12 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  34.67 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  34 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  35.42 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  28.57 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  28.57 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  29.14 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  37.04 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  30.16 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  30.4 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  40.32 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  34.59 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  29.37 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  32 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  32.54 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  31.75 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  30.94 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  27.78 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  28.67 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  32.03 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  35.62 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  36.3 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>