108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3711 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3711  TspO and MBR like protein  100 
 
 
162 aa  299  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  hitchhiker  0.000364074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  67.67 
 
 
165 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  59.26 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  58.02 
 
 
165 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  55.56 
 
 
165 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  50.6 
 
 
173 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  55.92 
 
 
159 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  48.68 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  56.05 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  50 
 
 
154 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  47.71 
 
 
162 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  50 
 
 
155 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  38.4 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  41.6 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  41.6 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  36.67 
 
 
157 aa  89  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  39.84 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  38.61 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  44.35 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  37.6 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  32.65 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  37.67 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  39.16 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  34.16 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  42.86 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  40.6 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  40.32 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  35.46 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  37.9 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  34.21 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  38.35 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  35.71 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  34.4 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  35.11 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  36.72 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  32.67 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  37.5 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  32.67 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  36.29 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  35.92 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  32.58 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  39.52 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  36.08 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  37.12 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  32 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  31.33 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  32.28 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  41.94 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  36.22 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  36.89 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  34.09 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  37.12 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  32.75 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  38.71 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  35.92 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  32.28 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  32.28 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  36.51 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  34.65 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  31.5 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  33.07 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  31.01 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  33.07 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  32.89 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  35.94 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  32.23 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  38.71 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  37.01 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  34.38 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  33.33 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  27.15 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  36.36 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  34.59 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  33.85 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  37.8 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  35.61 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  35.61 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  34.85 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  28.8 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  30.58 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  35.2 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  32.23 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  33.86 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  33.09 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  29.6 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  33.08 
 
 
184 aa  51.6  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  28.8 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  35.92 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  37.68 
 
 
199 aa  50.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2735  TspO and MBR like protein  32.8 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  30.07 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  32.05 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  28.05 
 
 
284 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  28.8 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1976  TspO and MBR like proteins  33.58 
 
 
170 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  33.33 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  30.07 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>