99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3404 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  40.6 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  38.36 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  40 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  43.2 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  35.34 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  37.59 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  40.62 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  38.1 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  38.71 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  38.4 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  33.58 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  35.71 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  33.82 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  37.3 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  36.3 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  38.33 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  34.92 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  34.68 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  38.4 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  37.5 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  35.71 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  38.73 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  36.51 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  37.78 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  35 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  34.92 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  35 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  33.8 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  33.83 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  34.27 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  34.11 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  32.14 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  35.71 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  36.81 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  36.84 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  33.58 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  27.33 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  34.38 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  32.87 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  31.2 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  28.57 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  33.86 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  32.09 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  32.37 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  34.4 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  32.84 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  30.94 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  33.7 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  31.25 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  36.15 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  33.07 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  32.64 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  31.69 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  33.33 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  33.07 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  30.77 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  41.94 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  30.83 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  33.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  28.74 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  32.56 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  36.22 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  29.92 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  31.2 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  33.08 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  30.67 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  33.85 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  30.71 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  29.92 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  33.08 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  30.4 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  30.53 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  35.38 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  28.8 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  41.43 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  31.75 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  32.03 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  31.2 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0769  TspO and MBR like proteins  38.57 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843937  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  28.8 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  30.15 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  30.77 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  28.57 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  29.73 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  28.57 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  31.25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  29.05 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  31.82 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  30.53 
 
 		 240 aa  47.4  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  32.03 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  31.85 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  32.54 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  30.65 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  30.83 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  31.78 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  29.37 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0665  CrtK protein  31.46 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.802516  normal  0.0539005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>