112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0909 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  100 
 
 
174 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  57.89 
 
 
135 aa  157  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0665  CrtK protein  55.91 
 
 
135 aa  124  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.802516  normal  0.0539005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  32.82 
 
 
171 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  35.77 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  36 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  37.6 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  35.77 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  37.69 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  38.89 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  37.01 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  30.3 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  34.15 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  33.83 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  30.71 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  33.08 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  31.5 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  31.25 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  37.3 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  35.94 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  37.6 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  37.3 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  31.5 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  32.84 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  28.35 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  36.8 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  35.34 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  36.8 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  30.77 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  35.56 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  32.39 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  32.31 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  32.54 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  34.65 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  31.2 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  29.37 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  32 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  27.97 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  30.2 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  32 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  29.6 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  32.58 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  32.56 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  34.68 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  35.2 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  28.12 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  29.58 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  35.2 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  31.2 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  30.4 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  32.84 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  26.32 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  32.48 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  36 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  30.37 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  29.69 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  31.82 
 
 
157 aa  61.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  31.5 
 
 
154 aa  61.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  36 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  32.06 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  30.65 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2817  TspO and MBR like protein  33.6 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49987  predicted protein  33.82 
 
 
284 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.418354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  30.65 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  33.09 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  29.85 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  29.6 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  31.2 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  28.68 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0035  TspO and MBR like proteins  31.82 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2570  TspO and MBR like proteins  32.03 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2615  TspO and MBR like proteins  32.03 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  29.86 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  32.28 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  29.86 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0269  tryptophan rich sensory protein  30.71 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  30.71 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  30.22 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1912  TspO and MBR like proteins  30.71 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  34.31 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  31.2 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  31.45 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  28.57 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  32.56 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0333  TspO and MBR like protein  33.61 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  33.58 
 
 
240 aa  54.7  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2609  TspO and MBR like proteins  32.81 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0191924  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  28.57 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  28.57 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  33.6 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  29.6 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3142  TspO- and MBR-like protein  29.1 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206469  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  32.33 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  33.08 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  33.87 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  30.6 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  32 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1026  TspO and MBR like protein  30.71 
 
 
159 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  28 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>