97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2570 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2615  TspO and MBR like proteins  100 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2570  TspO and MBR like proteins  100 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2609  TspO and MBR like proteins  98.74 
 
 
159 aa  314  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0191924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3142  TspO- and MBR-like protein  61.36 
 
 
139 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3382  TspO and MBR like proteins  59.85 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.344591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07980  tryptophan-rich sensory protein  42.86 
 
 
154 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1976  TspO and MBR like proteins  47.1 
 
 
170 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  29.86 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1272  TspO/MBR family protein  32.43 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2272  TspO and MBR related proteins  31.85 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1521  hypothetical protein  30.07 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0975957  normal  0.473043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  33.33 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  30.28 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  30.77 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3085  TspO and MBR like protein  30.77 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2859  TspO/MBR family protein  30.77 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0210  TspO and MBR like protein  32.35 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2411  TspO and MBR like proteins  30.5 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.00252248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0406  TspO-and MBR-like protein  33.54 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  30.52 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  29.79 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0909  TspO and MBR like proteins  32.03 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4445  TspO and MBR like protein  31.85 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1688  TspO and MBR like protein  39.37 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0268  TspO and MBR like proteins  36 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0012  TspO and MBR like protein  33.56 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2977  TspO and MBR like protein  29.58 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1018  TspO and MBR like protein  35.88 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244988  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3179  TspO/MBR family protein  32.59 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  31.52 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2955  TspO/MBR family protein  32.59 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  30.07 
 
 
199 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0041  TspO and MBR like proteins  30.41 
 
 
183 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.195212  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3164  TspO/MBR family protein  30.08 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  28.12 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1341  tryptophan-rich sensory protein  29.34 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1951  TspO and MBR like protein  33.1 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.515006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  30.34 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0950  TspO and MBR like protein  24.68 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00346634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3192  TspO/MBR family protein  30.08 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2934  hypothetical protein  30.08 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2076  TspO/MBR family protein  30.08 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5702  TspO and MBR like protein  27.89 
 
 
153 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232514 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  27.67 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  32.21 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01770  conserved hypothetical protein  28 
 
 
178 aa  51.2  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  30.32 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  39.53 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  27.34 
 
 
165 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6800  TspO and MBR like protein  31.21 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000256464  decreased coverage  0.0000000665741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  31.82 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3186  TspO/MBR family protein  31.11 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0168  TspO and MBR like proteins  30.41 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  27.4 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  27.97 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3520  TspO and MBR like protein  27.03 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756349  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3183  TspO/MBR family protein  30.83 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  31.34 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  28.36 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2041  TspO or MBR like protein  30.77 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0265  hypothetical protein  27.78 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4212  hypothetical protein  28.28 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4155  TspO and MBR like protein  33.59 
 
 
169 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2668  TspO and MBR like proteins  30.72 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3966  TspO and MBR like protein  35.14 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295778  normal  0.266571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08959  benzodiazepine receptor family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01430)  31.33 
 
 
180 aa  47.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4823  TspO/MBR family protein  32.43 
 
 
169 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.212375  normal  0.0256226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  26.99 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  32.43 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5290  TspO and MBR like protein  32.43 
 
 
165 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.772753  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0270  hypothetical protein  27.54 
 
 
148 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1855  TspO and MBR like protein  33.59 
 
 
165 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4187  TspO/MBR family protein  30.28 
 
 
180 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1962  TspO and MBR like protein  32.54 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3510  tryptophan rich sensory protein  33.08 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2867  TspO/MBR family protein  28.06 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3586  TspO/MBR family protein  29.93 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  32.61 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2694  tryptophan-rich sensory protein  27.41 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2636  TspO/MBR-related protein  28.78 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0665  CrtK protein  30.63 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.802516  normal  0.0539005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3404  TspO and MBR like proteins  32.35 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1911  peripheral-type benzodiazepine receptor  32.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1652  TspO and MBR like protein  28.46 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0884  TspO and MBR like protein  34.44 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  28.08 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  30.89 
 
 
173 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4469  TspO and MBR like protein  29.71 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1526  TspO and MBR like protein  29.13 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0420  TspO and MBR-like protein  35.62 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2811  TspO and MBR like proteins  31.4 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0587  TspO and MBR like proteins  30.77 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39466  predicted protein  31.58 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  37.36 
 
 
154 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  26.28 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  30.41 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  27.13 
 
 
164 aa  40.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>