43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0486 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  862    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  48.27 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  48.93 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  45.7 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  44.47 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  41.63 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  43.5 
 
 		 431 aa  326  6e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  43.26 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  42.34 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  38.25 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  41.41 
 
 		 430 aa  292  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  27.41 
 
 		 642 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  37.62 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  27.23 
 
 		 609 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  37.65 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  37.65 
 
 		 352 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  28.26 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  28.94 
 
 		 369 aa  90.5  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  31.82 
 
 		 380 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  26.77 
 
 		 637 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  30.48 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.82 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  26.09 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  27.54 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  25.07 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  25.07 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  24.78 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  26.42 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  28.16 
 
 		 547 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  23.46 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  25.31 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  21.57 
 
 		 875 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  30 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2627  S-layer domain-like protein  23.95 
 
 		 685 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 969 aa  49.7  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  26.63 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  21.68 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  20.85 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  29.69 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  25.13 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  24.11 
 
 		 824 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  23.85 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1337  hypothetical protein  20.85 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>