29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3149 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  756    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  81.62 
 
 
380 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  39.21 
 
 
369 aa  235  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  33.43 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  35.52 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  28.84 
 
 
370 aa  149  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  29.6 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  24.77 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  25.27 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  33.83 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  23.8 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  26.57 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  32.62 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  38.46 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  35.14 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  35.14 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  35.29 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1105  hypothetical protein  23.96 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.66021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  25.66 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  24.64 
 
 
642 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  27.24 
 
 
609 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  26.26 
 
 
521 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  26.77 
 
 
521 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  25.25 
 
 
521 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  22.75 
 
 
520 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  22.75 
 
 
520 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  25.38 
 
 
547 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  20.58 
 
 
637 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>