28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1268 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  769    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  79.95 
 
 		 378 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  39.52 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  36.07 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  34.67 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  33.52 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  29.71 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  29.86 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  27.75 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1105  hypothetical protein  24.92 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.66021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 450 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  25 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  31.06 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  36.94 
 
 		 430 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  27.94 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  25.17 
 
 		 609 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  21.78 
 
 		 533 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  25.59 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  26.42 
 
 		 547 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  21.9 
 
 		 569 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  23.04 
 
 		 637 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  23.96 
 
 		 521 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  22.4 
 
 		 521 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>