32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1060 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  857    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  96.52 
 
 		 431 aa  798    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  71.93 
 
 		 430 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  44.04 
 
 		 450 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 432 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  43.46 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  44.34 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  42.38 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  40.14 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  44 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  38.6 
 
 		 449 aa  299  8e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  28.15 
 
 		 642 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  25.98 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  35.14 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  23.95 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  26.18 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  24.88 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  27.63 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  24.03 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  27.21 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.13 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  23.88 
 
 		 563 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  21.14 
 
 		 533 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  24.43 
 
 		 569 aa  53.5  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  21.34 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  21.34 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  27.49 
 
 		 425 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  27.66 
 
 		 969 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  25.61 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  25.31 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  25.5 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>