32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0866 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  700    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  38.53 
 
 
370 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  39.53 
 
 
352 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  39.47 
 
 
354 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  37.62 
 
 
380 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  37.06 
 
 
378 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  32.25 
 
 
369 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  28.67 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  37.62 
 
 
428 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  29.97 
 
 
450 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  29.64 
 
 
467 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  37.58 
 
 
437 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  37.66 
 
 
432 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  33.67 
 
 
436 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  28.42 
 
 
449 aa  92.8  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  26.32 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  27.78 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  26.18 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  24.13 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  29.46 
 
 
642 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  30.49 
 
 
547 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  26.92 
 
 
637 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1105  hypothetical protein  22.62 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.66021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  30.87 
 
 
520 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  30.87 
 
 
520 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  26.83 
 
 
533 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  25.47 
 
 
569 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1636  hypothetical protein  30.84 
 
 
761 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.210403 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  30.84 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  28.44 
 
 
521 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 
969 aa  43.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>