45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0263 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  67.76 
 
 
520 aa  724    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  88.29 
 
 
521 aa  901    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  91.17 
 
 
521 aa  936    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  67.76 
 
 
520 aa  722    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1036    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  49.34 
 
 
547 aa  513  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0253  hypothetical protein  35.93 
 
 
409 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1660  hypothetical protein  35.73 
 
 
410 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0968  hypothetical protein  36.11 
 
 
410 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1561  hypothetical protein  34.97 
 
 
412 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1337  hypothetical protein  32.88 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  28.37 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  24.12 
 
 
875 aa  67.8  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  24.93 
 
 
517 aa  67  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1005  hypothetical protein  25.44 
 
 
788 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  26.13 
 
 
414 aa  63.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  24.72 
 
 
505 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  26.02 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  22.78 
 
 
642 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0984  hypothetical protein  26.71 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  24.04 
 
 
467 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  26.45 
 
 
428 aa  60.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  21.8 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  25.08 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  31.61 
 
 
413 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
969 aa  57.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  31.61 
 
 
418 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  28.48 
 
 
436 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  28.44 
 
 
344 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  25.25 
 
 
378 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  21.7 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  26.81 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  27.57 
 
 
352 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  22.47 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  23.08 
 
 
431 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  26.8 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  26.27 
 
 
354 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  23.78 
 
 
427 aa  47  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  21.05 
 
 
637 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  23 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  25.79 
 
 
370 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1743  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
851 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  23.86 
 
 
431 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1764  hypothetical protein  22.62 
 
 
791 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0673103  decreased coverage  0.000629319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  22.4 
 
 
380 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>