34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0680 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  80.53 
 
 		 413 aa  660    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  842    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  45.48 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  44.12 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  29.1 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  35.19 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  30.17 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  27.88 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  24.22 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  27.75 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  28.95 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  29.28 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  26.58 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  24.31 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  25.88 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  25.23 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  22.3 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  24.55 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  27.59 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  28.02 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  31.61 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  30.77 
 
 		 521 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  24.55 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  25.86 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  28.07 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0634  hypothetical protein  21.93 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0444592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  35.79 
 
 		 520 aa  53.1  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  35.79 
 
 		 520 aa  53.1  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3336  hypothetical protein  25.16 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.120426  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  22.03 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  21.03 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  31.4 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>