16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3336 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3336  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  929    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.120426  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0634  hypothetical protein  59.85 
 
 
419 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0444592  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  38.53 
 
 
433 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  34.63 
 
 
437 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  36.19 
 
 
462 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  37.36 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  38.35 
 
 
429 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  37.46 
 
 
342 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  27.47 
 
 
517 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  20.48 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  25.81 
 
 
413 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  21.34 
 
 
418 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  23.73 
 
 
521 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1561  hypothetical protein  23.04 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  22.61 
 
 
520 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  22.32 
 
 
520 aa  43.1  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>