34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0683 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  833    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  82.91 
 
 
418 aa  656    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  45.54 
 
 
411 aa  344  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  42.16 
 
 
415 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  29.62 
 
 
286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  36.87 
 
 
405 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  29.96 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  28.29 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  28.9 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  29.72 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  30.95 
 
 
429 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  26.67 
 
 
483 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  22.88 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.45 
 
 
517 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  24.21 
 
 
444 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  25.9 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  25.35 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  30.97 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  31.61 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  27.83 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  30.77 
 
 
521 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0634  hypothetical protein  22.95 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0444592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  32.17 
 
 
462 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  24.32 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  27.51 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3336  hypothetical protein  25.81 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.120426  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  35.79 
 
 
520 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  35.79 
 
 
520 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  28.93 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  23.42 
 
 
463 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  25.81 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  28.99 
 
 
425 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  30.67 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  22.54 
 
 
422 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>