31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3011 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  925    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  55.43 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  34.18 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0634  hypothetical protein  33.56 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0444592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  33.95 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3336  hypothetical protein  35.9 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.120426  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  34.55 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  37.02 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  25.99 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1561  hypothetical protein  29.44 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1660  hypothetical protein  22.8 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0253  hypothetical protein  22.73 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  22.3 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  25.38 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  25.47 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  25.08 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  21.37 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0968  hypothetical protein  22.55 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  32.17 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  23.97 
 
 		 521 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  25.31 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1337  hypothetical protein  25.65 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  20.71 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  25 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  30.66 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  24.04 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0654  hypothetical protein  26.32 
 
 		 701 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0110  hypothetical protein  24.55 
 
 		 266 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>