45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2655 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1046    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  27.18 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  29.11 
 
 
425 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  25.74 
 
 
427 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  28.96 
 
 
414 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  22.14 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3336  hypothetical protein  28.27 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.120426  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  25.6 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0984  hypothetical protein  24.68 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0634  hypothetical protein  24.04 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0444592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  25.95 
 
 
462 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  23.17 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  23.72 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  22.88 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  24.9 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  24.93 
 
 
521 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  23.42 
 
 
520 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  24.93 
 
 
521 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  23.42 
 
 
520 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  23.08 
 
 
437 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  25.14 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  22.69 
 
 
431 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  23.1 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  22.46 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  23.53 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  22.18 
 
 
437 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  23.99 
 
 
521 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  22.64 
 
 
429 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  22.43 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  21.94 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  23.82 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  25.6 
 
 
563 aa  54.7  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  27.71 
 
 
815 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  22.04 
 
 
415 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  20.3 
 
 
547 aa  50.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  22.41 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  22.6 
 
 
430 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0891  S-layer protein  23.81 
 
 
388 aa  48.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.987001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  23.66 
 
 
379 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1660  hypothetical protein  25.13 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0253  hypothetical protein  22.17 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.43 
 
 
6885 aa  44.3  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  23.66 
 
 
228 aa  43.9  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  21.1 
 
 
926 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  21.53 
 
 
824 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>