50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0573 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  67.18 
 
 		 520 aa  717    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1037    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  67.18 
 
 		 520 aa  715    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  91.17 
 
 		 521 aa  942    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  90.79 
 
 		 521 aa  916    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  48.96 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1660  hypothetical protein  36.19 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0968  hypothetical protein  36.11 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0253  hypothetical protein  35.16 
 
 		 409 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1561  hypothetical protein  36.41 
 
 		 412 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1337  hypothetical protein  32.88 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  28.93 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  24.63 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  25.14 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  23.97 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  24.93 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0984  hypothetical protein  26.79 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  21.9 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  22.05 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  23.84 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  29.07 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  25.87 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 436 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 		 969 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1005  hypothetical protein  23.51 
 
 		 788 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  23.35 
 
 		 637 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  26.26 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  28.08 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  23.97 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  27.36 
 
 		 342 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  27.8 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  22.38 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  26.9 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  23 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  24.85 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  26.98 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  24.85 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  24.38 
 
 		 409 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1764  hypothetical protein  23.77 
 
 		 791 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0673103  decreased coverage  0.000629319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  25.31 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  25.31 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  26.11 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  26.15 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  24.61 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1743  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 		 851 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  23.12 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  25.33 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  23.45 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>