16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1743 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1743  conserved hypothetical protein  100 
 
 
851 aa  1612    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  27.95 
 
 
875 aa  78.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
969 aa  74.3  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0771  hypothetical protein  25.72 
 
 
875 aa  65.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1636  hypothetical protein  26.81 
 
 
761 aa  62.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.210403 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1529  hypothetical protein  23.55 
 
 
866 aa  62  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.114366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0024  hypothetical protein  26.56 
 
 
693 aa  54.3  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0654  hypothetical protein  30.39 
 
 
701 aa  54.3  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1075  hypothetical protein  25.17 
 
 
711 aa  52  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.518834  normal  0.222972 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1060  hypothetical protein  24.52 
 
 
702 aa  51.6  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.655402  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2055  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 
835 aa  47.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0590406  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1712  hypothetical protein  22.47 
 
 
430 aa  47.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0448471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0936  hypothetical protein  26.84 
 
 
690 aa  47.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.900226  hitchhiker  0.00607638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  22.75 
 
 
642 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  25.1 
 
 
521 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  27.91 
 
 
521 aa  45.8  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>