34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2326 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  96.52 
 
 
431 aa  798    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
431 aa  858    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  72.51 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  43.85 
 
 
432 aa  333  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  44.1 
 
 
450 aa  331  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  43.46 
 
 
428 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  44.18 
 
 
437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  42.93 
 
 
437 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  40.19 
 
 
467 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  44 
 
 
436 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  39.19 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  27.9 
 
 
642 aa  96.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  23.88 
 
 
637 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  27.78 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  24.76 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  25.98 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  35.14 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  24.88 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  27.21 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  28.29 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.81 
 
 
517 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  21.66 
 
 
520 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  23.88 
 
 
563 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  21.66 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  24.65 
 
 
533 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  24.43 
 
 
569 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  26.96 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 
969 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  26.22 
 
 
429 aa  50.4  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  26.17 
 
 
437 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  25.31 
 
 
521 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  25.49 
 
 
875 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  23.86 
 
 
521 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>